Emissão de NF-e pela mesma empresa e inscrições estaduais diferentes

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Foto de perfil de Fabrício Márcio dos SantosFabrício Márcio dos Santos perguntado 1 ano

Boa tarde.
Me deparei com uma situação onde uma empresa (geradora de energia) sediada no MS tem um benefício fiscal quando vende para um cliente em SP, a operação é isenta ou tem ICMS 100% diferido.
Quando vende para cliente de SP a NF-e é emitida com a inscrição estadual (IE) de São Paulo, inclusive com o endereço do escritório da empresa em SP (não é filial).
Quando vende para outro estado utiliza a IE e endereço da empresa no seu estado (MS).
Em resumo, o mesmo CNPJ emite NF-e com inscrições estaduais diferentes, pelo que conversei com o contador não é IE do Substituto Tributário.
Essa situação realmente é possível? E de fato isso não é Substituto Tributário? É correto emitir a NF-e dessa forma?